Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PtprmP28828 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprmP28828 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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