Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Vpreb1P13372 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms