Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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DffaO54786 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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DffaO54786 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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DffaO54786 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DffaO54786 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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DffaO54786 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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DffaO54786 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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