Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Spocd1B1ASB6 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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