Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms