Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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