Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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