Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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