Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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