Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms