Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp38Q8BW70 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms