Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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