Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Hoxa13Q62424 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxa13Q62424 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms