Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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