Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Srsf6Q3TWW8 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms