Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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