Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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