Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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Hoxd1Q01822 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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