Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms