Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rom1P32958 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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