Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Spta1P08032 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms