Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DffaO54786 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DffaO54786 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
DffaO54786 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
DffaO54786 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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