Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KeraO35367 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms