Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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