Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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