Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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