Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms