Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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Cldn16Q925N4 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Cldn16Q925N4 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Cldn16Q925N4 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms