Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms