Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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H2-M10.4Q85ZW8 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms