Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms