Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Shroom4Q1W617 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms