Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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