Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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