Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SrprbP47758 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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SrprbP47758 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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SrprbP47758 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SrprbP47758 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms