Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
P20040 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
P20040 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
P20040 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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