Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfaP20033 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms