Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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DffaO54786 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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DffaO54786 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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DffaO54786 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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DffaO54786 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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DffaO54786 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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DffaO54786 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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DffaO54786 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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DffaO54786 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DffaO54786 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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