Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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