Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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