Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rtf1A2AQ19 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rtf1A2AQ19 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms