Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms