Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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