Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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