Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn22Q9D7U6 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms