Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms