Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms