Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Usp38Q8BW70 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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