Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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