Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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Herc4Q6PAV2 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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Herc4Q6PAV2 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Herc4Q6PAV2 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Herc4Q6PAV2 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Herc4Q6PAV2 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Herc4Q6PAV2 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Herc4Q6PAV2 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Herc4Q6PAV2 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms